Logo fi.boatexistence.com

Kuinka metagenomiikka tehdään?

Sisällysluettelo:

Kuinka metagenomiikka tehdään?
Kuinka metagenomiikka tehdään?

Video: Kuinka metagenomiikka tehdään?

Video: Kuinka metagenomiikka tehdään?
Video: Lukas Kohl: Methane emission from boreal Scots pine trees 2024, Saattaa
Anonim

Metagenomiikka määritellään ympäristönäytteen sisältämien genomien suoraksi geneettiseksi analyysiksi Aluksi ala alkoi ympäristön DNA:n kloonauksella, jota seurasi toiminnallinen ilmentymiseulonta [1], ja sitä täydennettiin sitten nopeasti ympäristön DNA:n suoralla satunnaisella haulikkosekvensoinnilla [2, 3].

Mikä on metagenomiikan prosessi?

Metagenomiikka käsittää DNA:n hankkimisen kaikista yhteisön mikro-organismeista, ilman että välttämättä tunnistettaisiin kaikkia asiaan liittyviä lajeja. Kun geenit on sekvensoitu ja verrattu tunnistettuihin sekvensseihin, näiden geenien toiminnot voidaan määrittää.

Mitä tekniikkaa metagenomiikassa käytetään?

Mikrobiyhteisöstä otetaan näyte merivedestä, sedimentistä, isäntäeläimestä tai muusta meriympäristöstä. Kerätyt solut hajotetaan sitten ja DNA uutetaan niiden lysaatista. Tekniikka, joka tekee metagenomiikan mahdolliseksi, on shotgun-sekvensointi, joka sekvensoi DNA:n satunnaiset alueet kohdistamattomalla tavalla.

Mitä ovat metagenomiikkatutkimuksen 3 vaihetta?

Metagenomiikan vaiheet ja prosessi:

  1. Näytekokoelma:
  2. DNA:n erottaminen:
  3. Näytevalmistelu:
  4. Esimerkkianalyysi:

Miten funktionaalinen metagenomiikka suoritetaan?

Funktionaalinen metagenomiikka sisältää DNA:n eristämisen mikrobiyhteisöistä koodattujen proteiinien toimintojen tutkimiseksi. Se sisältää DNA-fragmenttien kloonauksen, geenien ilmentämisen korvikeisännässä ja entsymaattisten toimintojen seulonnan.

Suositeltava: