BigWig on tiedostomuoto tiheän, jatkuvan datan näyttämiseen genomiselaimen raidalla, joka on luotu muuntamalla Wiggle (WIG) -muodosta. BigWig-muoto on kuvattu UCSC Genome Bioinformatics -verkkosivustolla, ja Broad Instituten tiedostomuotoopas tarjoaa lisätietoja.
Mikä on bigWig-muoto?
BigWig-muoto on tiheän, jatkuvan datan näyttämiseen, joka näytetään kaaviona BigWig-tiedostot luodaan alun perin WIG-tyyppisistä tiedostoista käyttämällä UCSC-ohjelmaa wigToBigWig. Vaihtoehtoisesti bigWig-tiedostoja voidaan luoda bedGraph-tiedostoista käyttämällä UCSC-ohjelmaa bedGraphToBigWig.
Kuinka käytän bigWig-tiedostoa?
Siirrä juuri luotu bigWig-tiedosto (myBigWig.bw) verkkokäyttöön http-, https- tai ftp-sijaintiin. Liitä URL-osoite mukautettuun kappaleen syöttölomakkeeseen tai luo mukautettu raita käyttämällä yhtä kappaletta. Liitä mukautettu jälkiviiva mukautetun raidanhallintasivun tekstiruutuun.
Mikä on bigWig-kappale?
bigWig Tracks ovat raitoja jatkuville signaaleille koko genomissa. Ne sopivat erilaisten "raakojen" koetulosten, kuten ChIP-Seq-signaalien, RNA-Seq-signaalien jne. näyttämiseen.
Kuinka luon bigWig-tiedoston?
On olemassa useita tapoja luoda suuria tiedostoja. Tämä edellyttää yleensä. bam-tiedosto heilutusraidaksi (. wig) ja muuntaa sitten heilutusraita binaariseksi bigwig-raidaksi (.
