Logo fi.boatexistence.com

Mikä on bigwig-tiedosto?

Sisällysluettelo:

Mikä on bigwig-tiedosto?
Mikä on bigwig-tiedosto?

Video: Mikä on bigwig-tiedosto?

Video: Mikä on bigwig-tiedosto?
Video: Converting BAM to BigWig 2024, Saattaa
Anonim

BigWig on tiedostomuoto tiheän, jatkuvan datan näyttämiseen genomiselaimen raidalla, joka on luotu muuntamalla Wiggle (WIG) -muodosta. BigWig-muoto on kuvattu UCSC Genome Bioinformatics -verkkosivustolla, ja Broad Instituten tiedostomuotoopas tarjoaa lisätietoja.

Mikä on bigWig-muoto?

BigWig-muoto on tiheän, jatkuvan datan näyttämiseen, joka näytetään kaaviona BigWig-tiedostot luodaan alun perin WIG-tyyppisistä tiedostoista käyttämällä UCSC-ohjelmaa wigToBigWig. Vaihtoehtoisesti bigWig-tiedostoja voidaan luoda bedGraph-tiedostoista käyttämällä UCSC-ohjelmaa bedGraphToBigWig.

Kuinka käytän bigWig-tiedostoa?

Siirrä juuri luotu bigWig-tiedosto (myBigWig.bw) verkkokäyttöön http-, https- tai ftp-sijaintiin. Liitä URL-osoite mukautettuun kappaleen syöttölomakkeeseen tai luo mukautettu raita käyttämällä yhtä kappaletta. Liitä mukautettu jälkiviiva mukautetun raidanhallintasivun tekstiruutuun.

Mikä on bigWig-kappale?

bigWig Tracks ovat raitoja jatkuville signaaleille koko genomissa. Ne sopivat erilaisten "raakojen" koetulosten, kuten ChIP-Seq-signaalien, RNA-Seq-signaalien jne. näyttämiseen.

Kuinka luon bigWig-tiedoston?

On olemassa useita tapoja luoda suuria tiedostoja. Tämä edellyttää yleensä. bam-tiedosto heilutusraidaksi (. wig) ja muuntaa sitten heilutusraita binaariseksi bigwig-raidaksi (.

Suositeltava: