Trypsiini katkaisee peptidisidoksen arginiinin karboksyyliryhmän tai lysiinin karboksyyliryhmän ja viereisen aminohapon aminoryhmän välillä. Katkaisunopeus tapahtuu hitaammin, kun lysiini- ja arginiinitähteet ovat sekvenssin tai kystiinin happamien aminohappojen vieressä.
Missä trypsiini pilkkoo aminohappoja?
Trypsiini katkaisee peptidejä lysiinin ja arginiinin aminohappotähteiden C-terminaaliselta puolelta. Jos proliinitähde on katkaisukohdan karboksyylipuolella, katkaisua ei tapahdu.
Mitä sekvenssiä trypsiini leikkaa?
Trypsiini lohkeaa yksinomaan C-terminaalista arginiini- ja lysiinijäännöksiin Melkein kaikissa suurissa massaspektrometriaan perustuvassa proteomiikan projekteissa käytetään trypsiiniä muuntamaan proteiiniseokset helpommin analysoitaviksi peptideiksi populaatiot.
Mitä aminohappoja trypsiini ja kymotrypsiini leikkaavat?
Trypsiini leikkaa lysiinistä ja arginiinista, kun taas kymotrypsiini. leikkaa tyrosiinia, fenyylialaniinia ja tryptofaania.. Mistä entsyymi tietää leikkaavansa siellä? Ehdota vaihtoehtoa aspartaatille ja histidiinille katalyyttisessä triadissa.
Mitä aminohappoja pepsiini pilkkoo?
Pepsiini katkaisee peptidisidoksia syklisten aminohappotähteiden ( tyrosiini, fenyylialaniini ja tryptofaani) aminopään puolelta ja hajottaa polypeptidiketjut pienemmiksi peptideiksi (Fange ja Grove, 1979).
