Useimmat STR:t löytyvät koodaamattomilta alueilta, kun taas vain noin 8 % sijaitsee koodausalueilla (3). Lisäksi niiden tiheydet vaihtelevat hieman kromosomien välillä. Ihmisillä kromosomissa 19 on suurin STR:ien tiheys (4). Ihmisen genomissa esiintyy keskimäärin yksi STR 2 000 emäsparia kohden (5).
Mistä löydän lyhyet tandemtoistot?
DNA-erottelutPCR-monistuksen jälkeen STR-amplikonin kokonaispituus mitataan DNA-profiilista löydetyssä kussakin alleelissa olevien toistojen lukumäärän määrittämiseksi. Tämä pituusmittaus tehdään kokoon perustuvalla erotuksella, johon liittyy geeli- tai kapillaarielektroforeesi (CE).
Mistä tandemtoistot löytyvät?
Tandemtoistoja esiintyy DNA:ssa, kun yhden tai useamman nukleotidin kuvio toistetaan ja toistot ovat suoraan vierekkäin. Useat proteiinidomeenit muodostavat myös tandemtoistoja aminohappojen primäärirakenteessa, kuten armadillo-toistoja.
Kuinka monta lyhyttä tandemtoistoa on olemassa?
Vuonna 1997 Federal Bureau of Investigation (FBI) nimesi 13 autosomaaliset STR-lokukset muodostamaan profiileista koostuvan tietokannan Combined DNA Index System (CODIS) ytimen. liittov altion, osav altion ja paikallisten oikeuslääketieteellisten laboratorioiden avustaja.
Onko kaikilla samat lyhyet tandemtoistot?
Näiden ei-koodaavien alueiden tutkiminen paljastaa toistuvia DNA-yksiköitä, joiden pituus vaihtelee yksilöiden välillä. Tutkijat ovat havainneet, että yksi tietty toistotyyppi, joka tunnetaan nimellä lyhyt tandemtoisto (STR), on suhteellisen helppo mitata ja verrata eri yksilöiden välillä
